Зміст
Площа під кривою прогресування хвороби (AUDPC) - це кількісна міра інтенсивності захворювання з часом. Застосовується в патології рослин для позначення та порівняння рівнів стійкості до захворювань серед різновидів рослин. Метод трапеції - це найпоширеніший спосіб розрахунку AUDPC. Він виконується за допомогою формули, розробленої Кемпбелом та Медденом у 1990 році, або шляхом побудови графіку відсотка зараженості від часу та підсумовування трапецій між часовими інтервалами.
Виміряйте прогресування хвороби
Правила та рекомендації щодо досліджень, які застосовуються для вимірювання конкретної хвороби та врожаю, яку ви досліджуєте. Необхідний розмір зразка рослини змінюється залежно від урожаю та хвороби. Наприклад, для вивчення фітофторозу в бульбах потрібен мінімум зразка з 40 рослин.
Посадіть відповідну кількість рослин, необхідних для дослідження.
Уважно стежте за ознаками захворювання. Дослідження, коли очікується поява ознак, щоб ви були готові. Наприклад, ознаки фітофторозу виникають приблизно через 30 - 40 днів після посадки і через 10 днів після останнього застосування фунгіциду.
Візуально оцініть відсоток зараженої площі листя у вашому зразку, як тільки ви помітите захворювання.
Реєструйте відсоток зараженої площі листя через регулярні проміжки часу. Дослідники беруть читання при фітофторі кожні сім днів, якщо хвороба прогресує швидше, ніж очікувалося. Показання проводяться кожні 14 днів, коли прогресування захворювання відбувається повільніше.
Зупиніть записувати вимірювання інфекції, коли відсоток зараження припиняється, а рівень прогресування захворювання.
Обчисліть AUDPC з рівняння
Додайте перші два відсотки зараженості, які ви зафіксували.
Розділіть результат додавання на два, щоб знайти середнє або середнє значення двох показань.
Помножте середнє або середнє значення на часовий інтервал, який становить кількість днів від першого читання до другого читання. Якщо ви взяли, наприклад, перше читання 20-го дня, а друге 27-го дня, то кількість днів або інтервал часу становить сім днів.
Результат запишіть в одиниці відсотків днів. Значення - площа трапеції.
Повторіть кроки один до чотирьох для другого та третього показань щодо зараження, які ви зробили. Їх результатом стане площа другої трапеції. Повторіть кроки один до чотирьох, поки не обчислите площі трапецій для всіх показань.
Додайте всі трапеції, щоб знайти AUDPC. Нижчі AUDPC являють собою повільніше прогресування захворювання та більшу стійкість до хвороби. Більш високі AUDPC являють собою швидше прогресування хвороби та більшу сприйнятливість до захворювання.