Зміст
Гель-електрофорез - це метод, який застосовується в лабораторіях для вимірювання та сортування ниток ДНК. Це необхідно, тому що ДНК у нормальних умовах занадто малий для маніпулювання, навіть при перегляді за допомогою більшості мікроскопів. Лабораторія гелевого електрофорезу використовує відносно просту процедуру, і та сама основна методика може бути використана і для розділення окремих білків.
Гелева матриця
Щоб розпочати процедуру гель-електрофорезу, спочатку потрібно створити гель. Зазвичай гелі виготовляють в тонких листах з використанням речовини, званої агарози. Порошкоподібну агарозу поміщають у колбу, після чого розчин солоної води, який називають буфером. Цю суміш агарози та буфера нагрівають до тих пір, поки дві речовини не розплавляться, а потім виливають у формуючу форму. Потім пристрій, зване гребінцем, поміщають на один кінець форми, перш ніж гель охолоне. Коли гель охолоне, гребінець видаляють, залишаючи невеликі прорізи, які будуть використані для утримання зразків ДНК.
Особлива характеристика охолодженої суміші агарози (її називають гелевою матрицею) випливає з того, що вона створюється солоною водою. При електрифікації матриця стане провідною, дозволяючи електроенергії текти по її довжині. Ще одна особлива властивість гелевої матриці - наявність регулярних мікроскопічних отворів. Ці отвори дозволять ниткам ДНК проходити через гелеву матрицю та полегшувати процес сортування.
Камера електрофорезу
Наступним вашим кроком є створення камери електрофорезу. Це невеликий прямокутний ящик, провідний з позитивним та негативним електричним з'єднанням на будь-якому кінці. Камери, як правило, неглибокі, досить малі, щоб поміститись на стільницю, і побудовані з прозорих матеріалів, таких як оргсклад.
Розчин солоної води наливають на дно камери електрофорезу, і гелеву матрицю трохи занурюють всередину цього розчину. Солона вода служить двом цілям: сприяє витраті електроенергії та підтримує вологу гелевої матриці. Оскільки ДНК приводиться в дію негативним зарядом, поставте матрицю, щоб ваші зразки були розташовані поруч з вашим негативним електричним з'єднанням.
Підготовка ДНК
Потім готуються зразки ДНК. Оскільки ДНК у розчині майже неможливо побачити, до кожного окремого зразка додається барвник, який називається завантажувальним буфером. Цей засіб також згущує розчин ДНК, роблячи його менш виснаженим і більш працездатним. За допомогою піпетки перенесіть зразок розчину ДНК у кожен змінний проріз в гелевій матриці. У порожній проріз між кожним зразком помістіть розчин ДНК, довжина якого ви вже знаєте (називається стандарт ДНК) для контролю експерименту та порівняння.
Увімкніть живлення
Тепер увімкніть камеру для електрофорезу. За умови негативної сили ваші зразки ДНК будуть переміщені по всій довжині камери. Невеликі нитки ДНК швидше рухатимуться через гелеву матрицю, і за короткий проміжок часу вони відокремляться від довших, повільніших ланцюгів. Барвник у фарбувальному агенті дозволяє прослідкувати сліди ДНК. Ви не зможете побачити окремі ланцюги ДНК, але нитки однакової довжини злипатимуться.
Заключні кроки
Коли сортується ДНК, матриця видаляється з камери електрофорезу. Потім ДНК фарбують, щоб забезпечити легше вимірювання та дослідження.