Зміст
Хромосомний кросовер, який також називають генетичним кросовер, - це нормальний процес, за допомогою якого гени рекомбінують. Рекомбінація збільшує генетичну варіативність за рахунок рекомбінації для отримання різних ознак.
TL; DR (Занадто довго; Не читав)
Втручання генів - це міра незалежності кросоверів один від одного. Якщо кросовер в одній області впливає на кросовер в іншій області, ця взаємодія називається перешкодою. Інтерференція = 1 - c.o.c., де c.o.c. - коефіцієнт збігу (c.o.c.)
У людини 23 хромосоми. Під час мейозу одна клітина ділиться двічі, утворюючи чотири дочірні клітини. Ці чотири дочірні клітини мають половину кількості хромосом материнської клітини. Потім вони можуть приєднатися до іншої хромосомної половини або з яйцеклітини, або з сперми, щоб стати цілою парою.
Іноді ці дві частини не залишаються разом. Якщо шматки зламаються, вони можуть потім з'єднатися з іншим зламаним шматочком. Дві генетичні копії, які рекомбінують, називаються хроматидами. Такі проблеми, як синдром Дауна чи інші генетичні розлади, можуть бути спричинені при неправильному поєднанні генів.
Більшість кросоверів відбуваються нормально. Іноді відбувається подвійний кросовер. Це коли хроматиди об'єднуються в двох точках замість однієї. У другій точці контакту хроматиди можуть знову відокремитись і знову обмінятися генетичною інформацією.
Втручання генів - це міра незалежності кросоверів один від одного. Іншими словами, оскільки ви знаєте, що виникають подвійні кросовери, ви повинні відповісти на питання про те, чи є кросовери в сусідніх областях хромосоми незалежними чи ні. Якщо вони не є незалежними, це означає, що кросовер в одному регіоні впливає на ймовірність виникнення кросовера в сусідній області. Якщо кросовер в одній області впливає на кросовер в іншій області, ця взаємодія називається перешкодою.
Як розрахувати перешкоди
Розглядаючи, як обчислити перешкоди, першим кроком є обчислення коефіцієнта збігу (c.o.c.). C.o.c. у свою чергу залежить від ймовірності подвійного кросовера, званого значенням частоти кросовера, також відомого як "частота подвійних рекомбінантів".
Коефіцієнт збігу - відношення спостережуваних до очікуваних подвійних рекомбінантів.
Коефіцієнт збігу = частота, що спостерігається подвійними рекомбінантами / очікувана частота подвійних рекомбінантів
Очікувана кількість подвійних рекомбінантів у вибірці двох незалежних областей дорівнює добутку рекомбінантних частот у сусідніх областях.
Потім інтерференція визначається наступним чином:
інтерференція = 1 - c.o.c.
Інтерференція говорить про те, як сильно кросовер в одній з областей ДНК заважає утворенню кросовера в іншій області.
Якщо інтерференція дорівнює нулю, це означає, що подвійні кросовери відбуваються так, як передбачено, і що кросовер в одній області відбувається незалежно від кросовера в сусідній області.
Якщо перешкода дорівнює 1, це означає, що інтерференція завершена і не спостерігається подвійних кросоверів, оскільки кросовер в одній області виключає ймовірність перехрестя в сусідній області.
Зазвичай ваші дані показуватимуть перешкоди між 0 і 1. Значення, що перевищують нуль, але нижче одного, вказують на те, що відбувається перешкода.