Зміст
- TL; DR (Занадто довго; Не читав)
- Опис рибосом
- Поширеність рибосом
- Рибосоми є білковими фабриками
- Хто відкрив рибосоми?
- Відкриття будови рибосом
- Що таке рибоцим?
- Класифікація рибосом за цінностями Шведберга
- Важливість структури Рибосоми
Рибосоми відомі як протеїни всіх клітин. Білки контролюють і будують життя.
Тому рибосоми є важливими для життя. Незважаючи на їх відкриття в 50-х роках минуло кілька десятиліть, перш ніж вчені по-справжньому з’ясували будову рибосом.
TL; DR (Занадто довго; Не читав)
Рибосоми, відомі як білкові фабрики всіх клітин, були вперше відкриті Джорджем Е. Паладом. Однак структура рибосом була визначена десятиліттями пізніше Ада Е. Йонат, Томасом А. Штайцом та Венкатраманом Рамакришнаном.
Опис рибосом
Рибосоми отримали свою назву від "рибо" рибонуклеїнової кислоти (РНК) і "сома", що з латини називається "тіло".
Вчені визначають рибосоми як структуру, що знаходиться в клітинах, одну з декількох менших клітинних підмножин органели. Рибосоми мають дві субодиниці, одну велику і одну малу. Ядерце утворює ці субодиниці, які фіксуються між собою. Рибосомальна РНК та білки (рибопротеїни) складають рибосому.
Деякі рибосоми плавають серед цитоплазми клітини, інші прикріплюються до ендоплазматичного ретикулуму (ЕР). Ендоплазматичний ретикулум, усіяний рибосомами, називається шорсткий ендоплазматичний ретикулум (RER); то гладкий ендоплазматичний ретикулум (SER) не приєднано рибосом.
Поширеність рибосом
Залежно від організму клітина може мати кілька тисяч, а то й мільйонів рибосом. Рибосоми існують як у прокаріотичних, так і в еукаріотичних клітинах. Вони також можуть бути виявлені в бактеріях, мітохондріях і хлоропластах. Рибосоми більш поширені в клітинах, які потребують постійного синтезу білка, як клітини головного мозку або підшлункової залози.
Деякі рибосоми можуть бути досить масивними. У еукаріотів вони можуть мати 80 білків і складатися з декількох мільйонів атомів. Їх РНК-порція займає більше маси, ніж їх частина білка.
Рибосоми є білковими фабриками
Рибосоми беруть кодони, що представляють собою серію з трьох нуклеотидів, з месенджерної РНК (мРНК). Кодон слугує шаблоном з ДНК клітини для отримання певного білка. Потім рибосоми переводять кодони і співпадають з ними з амінокислотою перенесення РНК (тРНК). Це відомо як переклад.
Рибосома має три сайти зв'язування тРНК: an аміноацил сайт зв'язування (сайт) для приєднання амінокислот, a пептидил сайт (P сайт) та an Вхід сайт (E-сайт).
Після цього процесу переведена амінокислота будується на білковому ланцюжку, який називається a поліпептид, поки рибосоми не закінчать свою роботу з виготовлення білка. Після вивільнення поліпептиду в цитоплазму він перетворюється на функціональний білок. Цей процес тому рибосоми часто визначають як фабрики білків. Три стадії вироблення білка називаються ініціацією, подовженням та трансляцією.
Ці машиноподібні рибосоми працюють швидко, приєднуючись до 200 амінокислот в хвилину; прокаріоти можуть додавати 20 амінокислот в секунду. Складні білки потребують декількох годин, щоб зібратися. Рибосоми складають більшу частину приблизно 10 мільярдів білків у клітинах ссавців.
Завершені білки, в свою чергу, можуть зазнати подальших змін або складання; це називається пост-трансляційна модифікація. У еукаріотів Апарат Гольджі завершує білок до його вивільнення. Як тільки рибосоми закінчують свою роботу, їх субодиниці або переробляються, або демонтуються.
Хто відкрив рибосоми?
Джордж Е. Паладе вперше виявив рибосоми в 1955 р. Опис рибосоми Палада зобразив їх як цитоплазматичні частинки, пов'язані з мембраною ендоплазматичного ретикулума. Палад та інші дослідники виявили функцію рибосом, яка полягала в синтезі білка.
Френсіс Крик продовжував би формувати центральна догма біології, який узагальнив процес побудови життя як "ДНК робить РНК виробляє білок".
Хоча загальну форму визначали за допомогою електронно-мікроскопічних зображень, для визначення фактичної структури рибосом знадобиться ще кілька десятиліть. Багато в чому це було зумовлено порівняно величезними розмірами рибосом, що гальмувало аналіз їх структури в кристалічній формі.
Відкриття будови рибосом
Поки Палад відкрив рибосому, інші вчені визначили її будову. Три окремі вчені відкрили будову рибосом: Ада Е. Йонат, Венкатраман Рамакришнан та Томас А. Штейтс. Ці троє вчених були нагороджені Нобелівською премією з хімії у 2009 році.
Відкриття тривимірної структури рибосоми сталося в 2000 році. Йонат, 1939 року народження, відкрив двері для цього одкровення. Її початкова робота над цим проектом розпочалася у 1980-х роках. Вона використовувала мікроби з гарячих джерел, щоб виділити їх рибосоми, завдяки їх міцній природі в суворих умовах. Вона змогла кристалізувати рибосоми, щоб їх можна було проаналізувати за допомогою рентгенокристалографії.
Це створило схему крапок на детекторі, щоб можна було виявити положення рибосомних атомів. Зрештою, Йонат отримав високоякісні кристали за допомогою кріокристалографії, тобто рибосомальні кристали були заморожені, щоб запобігти їх руйнуванню.
Потім вчені намагалися з'ясувати "фазовий кут" для малюнків крапок. У міру вдосконалення технології вдосконалення процедури призвели до деталізації на одноатомному рівні. Штайц, 1940 року народження, зміг виявити, в яких етапах реакції були пов'язані які атоми, при з'єднаннях амінокислот. Він знайшов фазову інформацію для більшої одиниці рибосоми в 1998 році.
Рамакришан, 1952 року народження, в свою чергу працював над вирішенням фази рентгенівської дифракції для хорошої молекулярної карти. Він знайшов фазову інформацію для меншої субодиниці рибосоми.
Сьогодні подальші досягнення в повній кристалографії на рибосомі призвели до кращого розсмоктування складних структур рибосоми. У 2010 році вчені успішно кристалізували еукаріотичні 80S рибосоми Saccharomyces cerevisiae і змогли скласти карту його рентгенівської структури ("80S" - це тип категоризації, який називається значенням Сведберга; детальніше про це незабаром). Це в свою чергу призвело до отримання більшої інформації про синтез і регуляцію білка.
Рибосоми менших організмів до цих пір виявилися найпростішими в роботі з визначенням структури рибосоми. Це тому, що самі рибосоми є меншими і менш складними. Потрібні додаткові дослідження, щоб допомогти визначити структури рибосом вищих організмів, таких як у людей. Вчені також сподіваються дізнатися більше про рибосомну структуру збудників, щоб допомогти у боротьбі з хворобами.
Що таке рибоцим?
Термін рибозим відноситься до більшої з двох субодиниць рибосоми. Рибозим функціонує як фермент, звідси і його назва. Він служить каталізатором при складанні білка.
Класифікація рибосом за цінностями Шведберга
Значення Шведберга (S) описують швидкість осідання в центрифузі. Вчені часто описують рибосомальні одиниці, використовуючи значення Сведберга. Наприклад, прокаріоти мають 70S рибосоми, які складаються з однієї одиниці з 50S і однієї з 30S.
Вони не складаються, оскільки швидкість осідання має більше стосунок до розміру та форми, ніж молекулярної маси. Еукаріотичні клітини, з іншого боку, містять 80S рибосоми.
Важливість структури Рибосоми
Рибосоми є важливими для всього життя, оскільки вони складають білки, які забезпечують життя та його будівельні блоки. Деякі необхідні для життєдіяльності людини білки включають гемоглобін в еритроцитах, інсулін та антитіла, серед багатьох інших.
Як тільки дослідники оприлюднили структуру рибосом, це відкрило нові можливості для дослідження. Одне з таких напрямків розвідки - для нових антибіотиків. Наприклад, нові препарати можуть зупинити захворювання, орієнтуючись на певні структурні компоненти рибосом бактерій.
Завдяки структурі рибосом, виявлених Йонатом, Штайцом та Рамакришнаном, вчені тепер знають точні місця розташування між амінокислотами та місцями, де білки залишають рибосоми. Нулювання місця, де антибіотики приєднуються до рибосом, відкриває набагато більшу точність дії наркотиків.
Це має вирішальне значення в епоху, коли раніше стійкі антибіотики зустрічалися зі стійкими до антибіотиків штамами бактерій. Отже, відкриття структури рибосом має велике значення для медицини.