Зміст
- Основне розуміння альтернативного сплайсингу
- Екзон Пропуск
- Взаємовиключні Екзони
- Альтернативні 3-сайтові приймачі
- Альтернативні 5 'сайти донорів
- Затримка інтрону
Альтернативні сплайсинг - невід'ємна складова біорізноманіття. Різні види використовують ці механізми для здійснення регуляторних функцій. Основна перевага сплайсингу полягає в тому, що за допомогою сплайсировки інтронів та екзонів можуть утворюватися декілька білків з одного гена. Однак ці механізми можуть також викликати різні захворювання, якщо їх не регулювати. Найпоширенішими механізмами є пропуск екзону, взаємовиключні екзони, альтернативні сайти акцепторів, альтернативні донорні сайти та утримання інтронів.
Основне розуміння альтернативного сплайсингу
••• Comstock / Comstock / Getty ImagesНе є перебільшенням сказати, що без альтернативного сплайсування біорізноманіття було б неможливим. Альтернативно сплайсинг може продукувати кілька білків з одного гена. Ця гнучкість дозволяє одному і тому ж гену сприяти різним ознакам. Це можливо завдяки екзонам, що представляють собою ділянки нуклеотидів, що залишаються в продукті РНК, та інтрони, які видаляються шляхом сплайсингу РНК. Існує багато способів альтернативного сплайсингу, які сприяють біорізноманіттю еукаріотів. Активатори, такі як стартовий кодон AUG, на місці сплайсингу сприяють сплайсингу. Ці механізми залежать від кожної ситуації і, як вважається, регулюють функції клітин на основі конкретних умов. Однак неправильне сплайсинг також може сприяти різним захворюванням, включаючи рак.
Екзон Пропуск
Цей механізм також відомий як касетний екзон, де ексон виділяється з гена під час транскрипції. Прикладом може бути ген dsx у D. melanogaster (плодова муха). У самців є екзони 1, 2, 3, 5 і 6, тоді як у жінок 1, 2, 3 і 4. Сигнал поліаденіляції в екзоні 4 призводить до припинення транскрипції в цій точці. Екзон 4 додається жінкам через один з активаторів, присутні тільки у жінок, а не у самців.
Взаємовиключні Екзони
••• Thomas Northcut / Lifesize / Getty ImagesУ випадку взаємовиключних екзонів під час транскрипції зберігається лише один з двох послідовних екзонів. Прикладом є регуляція екзонів 8а та 8 у кальцієвих каналах CaV1.2. При синдромі Тімоті альтернативні форми цих двох екзонів можуть призвести до різних симптомів захворювання, що викликає порушення гомеостазу кальцію, необхідного для скорочення м’язів. Однак обидва екзони не можуть існувати у пацієнтів; тільки один з них транскрибується, хоча обидва присутні в гені.
Альтернативні 3-сайтові приймачі
Використовується з'єднання з'єднання на 3'-кінці, змінюючи 5'-межу нижнього потоку екзона. Прикладом може бути білок активатора Трансформатора (Tra), присутній у жінок D. melanogaster (плодова муха). Оригінальний ген Tra містить два акцепторні сайти, де ген може розщеплюватися під час транскрипції. Самці використовують сайт, що приймає акцептор, що включає кодон для раннього зупинки. При цьому утворюється нефункціональний білок. Самки використовують нижню ділянку акцептора, що спричиняє висічення стоп-кодону у складі інтрону, утворюючи функціонуючий білок Tra.
Альтернативні 5 'сайти донорів
••• Образи Comstock / Comstock / Getty ImagesВикористовується з'єднання з'єднання у 5 ', змінюючи 3'-межу верхнього екзона. Хоча альтернативні сайти-акцептори призводять до невеликих варіацій послідовностей білків, альтернативні донорні сайти можуть призвести до різких відмінностей у послідовності та структурі білка, оскільки це може спричинити зміну кадрів. Прикладом може бути альтернативне сплайсинг гена BTNL2 на донорському сайті. Використання сайту вище за течією, а не нижнього місця, призводить до скорочення білка без С-кінцевого домену IgC або трансмембранної спіралі. Це призводить до схильності до хронічного запального захворювання.
Затримка інтрону
Як і пропуск, який пропускає екзон, екзон зберігається в мРНК, але на відміну від пропускання екзону, екзон не є фланкованим інтронами. Якщо інтрони існували, вони часто кодуються в ділянках кодування серед амінокислот близьких по екзонам, стоп-кодону або зміщення рамки зчитування, що призводить до того, що білок стає нефункціональним. Це найменш поширений механізм альтернативного сплайсингу.